理学院，原名基础科学学院，于2000年4月由基础课部升格而来。
学院下设三个系：数学与信息科学系、应用物理系、工程图学与应用软件系；四个实验中心：大学物理实验中心、科学与工程计算实验中心、工程制图实验中心、光电信息实验中心；四个研究所：应用数学研究所、应用物理研究所、计算机图形学与CAD研究所、系统工程与密码学研究所。学院现有信息与计算科学和光信息科学与技术2个本科专业，在校本科生近500人，两个一级硕士点。
学院现有教职工100余人，其中专任教师90余人。专任教师中教授10人、副教授40余人，博士30余人，具有硕士以上学位教师的比例超85％。教师中现有江西省学科带头人、江西省新世纪百千万人才、江西省五一劳动奖章获得者、江西省教学名师等省级以上荣誉人员近20人。
学院连续五年获得江西省自然科学奖，近三年取得国家自然科学基金近30项，每年的科研经费数都超过600万元，每年发表SCI检索论文40篇以上。图论和量子信息2个科研团队的研究水平处于江西省领先地位。
学院现有江西省精品资源共享课程4门、江西省精品在线开放课程2门，国家规划教材4部，获全国多媒体课件大赛一等奖1项、三等奖1项，全国微课教学比赛一等奖1项，江西省多媒体课件大赛一等奖1项，江西省微课教学比赛一等奖1项、二等奖1项，获江西省教学成果一等奖2项、二等奖4项，江西省优秀教材一等奖7项、二等奖2项。现有“大学数学教学团队”和“工程图学教学团队”2个省级教学团队。
学院注重学生创新创业能力培养，腾杰工作室荣获全国大学生“小平科技创新团队”称号，学院老师指导学生获挑战杯全国三等奖1项，近五年指导学生参加全国大学生数学建模竞赛获全国一等奖、二等奖10余项，指导全国大学生数学竞赛获奖率高达50%以上，近两年指导学生参加美国大学生学生建模竞赛获国际一等奖、二等奖6项。
